由于图特摩斯三世的进攻，敌人陷入一片混乱。“当他们看到陛下战胜他们时，他们带着恐惧的脸孔没有秩序地逃往美吉多去，他们抛弃了自己的马和金银制的战车”。在这种情况下，如果埃及士兵乘胜追击，美吉多城便唾手可得。可是，尽管法老声嘶力竭地叫喊，埃及士兵还是只顾抢劫金银财物，掠取战利品和捆绑俘虏。这给了敌人逃脱和重组防御力量的时间。图特摩斯三世无奈之际只好下令围城。在以后的七个月中，法老砍光了城郊果园中的全部橄榄树和无花果树，断绝城中的粮食和水源，最后迫使美吉多守兵投降。亚洲联盟的首领除卡迭石国王逃跑外，其余全部被俘。
在美吉多大战之后，图特摩斯三世又领导埃及人多次通过迦南前往叙利亚。不但大规模入侵叙利亚和巴勒斯坦，还不断出征努比亚，把埃及帝国的南界扩展到尼罗河第四瀑布。他的军事征服，使埃及成为一个空前绝后的超级军事霸国。埃及帝国的版图正是在图特摩斯三世之时，达于最大规模。图特摩斯三世也因此被后人称为“古埃及的拿破仑”。
