有些正常的男性虽然他们的睾丸发育正常，但他们的阴茎却比较短小，虽然也能够勃起和射精，但常常会造成性心理上的异常，甚至于怀疑自己的性能力，在我国虽然还没有对这些短小阴茎者在男性中所占的比例进行过科学的统计，但从日常生活中所遇到的情况来看，这类病人的确还不算少。国外的性医学专家的研究表明，男性的阴茎短小主要与下列因素有关：
1、遗传因素
阴茎与身体其它器官一样，其大小及形态特点要受遗传基因的控制与影响。
2、发育与营养状况
一般来说，成年男性体格健壮，身材高大，其外生殖器包括阴茎、阴囊的发育也较好，阴茎可能较为粗大，反之则可能小一些，但是值得指出的是，阴茎的大小不会与身高成正比例，常可以见到一些身高不足1。60米的男性，其阴茎勃起时可以达到18厘米以上。
3、肥胖
一些小腹部、耻骨联合部、会阴部脂肪丰满突出的男性，往往阴茎的发育欠佳，比起正常男性的阴茎会相对短小。的确，与肥大的身体相比，这种短小的阴茎在婚后可能会给性生活带来一定的困难和不理想。
4、其它方面
如内分泌紊乱，男性激素水平不足，阴睾或阴囊肿胀产生的阴茎回缩等，都可能造成阴茎短小。
