现有8个内蒙古自治区院士专家工作站和9个包头市院士专家工作站。设有内蒙古自治区基因诊断研究所、内蒙古自治区应用解剖研究所、内蒙古自治区消化病研究所、内蒙古自治区高血压病研究所、内蒙古自治区全科医学培训中心等研究培训机构。
近5年来，承担国家级科研项目63项，获得内蒙古自治区科学技术进步奖、自然科学奖共计二等奖6项、三等奖10项。获得内蒙古自治区哲学社会科学优秀成果政府奖二等奖1项、三等奖2项。学校有附属医院、教学医院和实习医院共计32所，其中2所为直属附属医院。有预防医学专业实践教学基地21个、药学专业实践教学基地10个、法医学专业实践教学基地10个，还有其他专业实践教学基地46个。
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内蒙古医科大学
内蒙古医科大学坐落于内蒙古自治区首府呼和浩特市，是一所以医学为主，集理学、管理学、工学、文学、法学于一体的多科性高等医药院校。学校成立于1956年，是新中国在少数民族地区最早建立的高等医学院校之一，当时隶属于国家卫生部，1958年划归内蒙古自治区管理。前身为内蒙古医学院，2012年，经教育部批准，更名为内蒙古医科大学。2017年，成为内蒙古自治区人民政府、国家卫生计生委、教育部共建高校。2018年，经国务院学位委员会批准成为博士学位授予单位。
学校设有基础医学院、药学院、中医学院、蒙医药学院、公共卫生学院、口腔医学院、卫生管理学院(自治区卫生政策研究所)、外国语学院、计算机信息学院、护理学院（卫生技术学校）、马克思主义学院、实践教学部、体育教学部、研究生学院、继续教育学院等15个教学单位，有3所直属附属医院、4所非直属附属医院，10所临床医学院。在区内外设有实践教学基地109个。其中，医学类专业实践教学基地72个、非医学类专业实践教学基地37个。
国家特色专业：蒙医学 中药学 蒙药学
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内蒙古民族大学
内蒙古民族大学始建于1958年，2000年由原内蒙古民族师范学院、内蒙古蒙医学院、哲里木畜牧学院合并组建而成，是内蒙古自治区重点建设高校，内蒙古自治区人民政府和国家民族事务委员会共建高校，也是国家“十三五”中西部高校基础能力建设工程（二期）支持高校。
蒙医药是我校特色学科和优势学科，2012年蒙药学获批服务国家特殊需求博士人才培养项目，2015年蒙医学专业获批教育部“卓越医生培养计划”，获国家级科研项目300余项、经费达到8000余万元，在学科建设、人才培养和产学研结合等方面处于国内外领先地位，成为我国蒙医学领域教学、科研、临床人员较为集中，实验室仪器设备和临床教学条件优越，研究方向明确、民族特色鲜明的重要人才培养基地和学术研究基地。
现有直属附属医院1所，是国家三级甲等民族医综合医院，是全国唯一一家国家级重点蒙西医结合医院，也是国家执业医师考试考点、国家首批蒙医住院医师规范化培训基地和临床住院医师规范化培训基地，有卫生技术人员1570人（含医、护、检验、药师等），开放床位1500张。有非直属附属医院4所，第二附属医院（内蒙古林业总医院）、第三附属医院（赤峰市第二医院）、呼伦贝尔临床医学院（呼伦贝尔市人民医院）。附属蒙医医院（通辽蒙医中心医院 ）在建。
