重新回到北京的她，兼顾学业的同时，还有幸被央视相中，开始迈向事业新的高峰。
1988年，广电总台一纸调令发到长沙电视台，被告知“台柱子”肖晓琳即将被调离原岗位，得到入职央视的机会。
领导心中五味杂陈，即为肖晓琳感到自豪，也为电视台失去一员大将而黯然伤神。
入职央视后，肖晓琳很快被委以重任，担任节目制片人且担任《观察与思考》栏目主持人。
在当时央视人才欠缺，身为制片人的肖晓琳还曾短暂主持《新闻联播》，那时候新闻联播还是录播，直到1995年才开始直播。
恰逢《新闻联播》转录播为直播那年，肖晓琳感觉自身发展达到瓶颈，于是决定先放下事业，赴美深造两年。
学有所成归来后，肖晓琳为央视创办普法类节目《今日说法》，她事事亲力亲为，特地找来优秀主持人张绍刚作为搭档，
还挖掘了长相帅气还被保送北大法律系的天才播音员撒贝宁。
肖晓琳成为了撒贝宁的伯乐，撒贝宁也不负众望成为真正的千里马，即便时至今日依旧活跃在央视舞台。
《今日说法》一经播出，收视率居高不下，立马成为央视热播节目之一，节目既能普法，也能满足观众的好奇心，听到一些生活中接触不到的惊天奇案。
节目取得巨大成功，可肖晓琳并未停下前进的脚步，她陆续成为法制节目《社会经纬》、以及时事类节目《焦点访谈》、《半边天》等节目主持人。
在离开《今日说法》栏目组后，又创办诉说人生百态、体现真善美的纪实类口述记录片《讲述》，
肖晓琳主持水平一流，创新能力也不弱，是众多央视工作者心中的偶像，也是老一辈观众心中的“最佳央视主持。”
2001年，在金话筒评选中，肖晓琳以过往出色业务能力得以被提名，本以为奖项已是囊中之物，没想到最后拿下第五届金话筒奖的是一位名不见经传的主持人。
