故事发生在二十世纪初的大上海，程勇靠着印度保健品维持生计，他和前妻三观不合，离婚后前妻嫁了个富二代，一直想带宝贝儿子出国移民。她委托律师争取抚养权，可程勇勃然大怒对律师动手动脚，还把怀孕的前妻不小心撞到在地，作为弟弟的警察曹斌怒火冲天，还差点让程勇今晚在医院度过了。吕受益患有“慢粒白血病”，为了治病老吕需要吃进口特效药格列宁，一瓶就得37000，而印度盗版药一瓶才2000，效果都差不多。所以他希望常去印度走私的程勇能搞一些回来。后来因家人住院需要治疗，程勇无奈的接下这单生意救急。
赶到印度药厂才发现药厂批发价一瓶才500，药店的零售价一瓶2000！药厂厂长表示如果想拿下代理权，就得在一个月内卖完100瓶药。这下程勇和老吕忙死忙活药品依然滞销，老吕灵机一动找到了白血病的QQ病友群的群主思慧。各病友群群主被思慧召集在一起搞起内部销售。为了得到代理权，老吕找个会英语交流的病友刘牧师，在程勇一番怂恿下老刘也上了贼船。某天老吕手里的药被黄毛少年抢走了。程勇气急败坏抓住了黄毛，原来这年轻人也患上白血病，抢来的药也分给了同住的病友，因此程勇也没追究，但要他打工来还钱。
程勇、老吕、思慧、刘牧师和黄毛的贩药小团队正式诞生。代理权也被程勇顺利拿下。但因为盗版药烂大街，正版药方出于血亏选择报警。警方派猛将曹斌出马，才发现这盗版药真能治病，但局长却说走私药必定假药。另一头程勇给大伙们发完药分完钱后，今晚一起去迪厅乐呵乐呵。程勇在迪厅是替思慧解围后就送思慧回家，思慧到家后便主动去洗澡，没想到她的女儿就在旁边，程勇顿时索然无味。他离开了以后，思慧也很感激。后来老太太误食假药住了医院，家属就来找程勇麻烦，发现是假药贩子张长林的问题。众人在会场搞事情，揭发了张长林的这场不可告人的秘密骗局。警察赶来时，骗子已经跑了，程勇等人只好跟着回警察局做笔录。
晚上张长林居然找到了程勇，想花两百万人民币买下这盗版药的代理权，还调侃程勇肯定被抓。第二天程勇刚拿回来一批新货，警察马上就来检查，好在大家提前准备，没搜到盗版药。经过考虑后程勇决定金盆洗手，散伙饭也告知大家以后盗版药改由张长林来卖，众人不理解，可程勇上有老下有小不想被抓坐牢。随后大伙们感谢了程勇，就别各奔东西，只有老吕还不相信。一年后程勇开了一家服装厂，老吕媳妇找到程勇交涉后发现，断药的老吕的情况越来越差，老吕媳妇求程勇再弄一些印度格列宁救救老吕。他身体已经进入急变期，因为老吕的死，程勇决定重新开始卖药。某天曹斌心软放走了所有人，他跟局长求情暂时缓一缓追查盗版药，但局长表示法律为大。
这天潜逃的张长林找到程勇要跑路费，程勇多给了他十万，不过盗版药一事得守口如瓶，张长林得知程勇卖药压根不赚钱以后，劝了他一句：“我卖药这么多年，发现这世上只有一种病，穷病。这种病你没法治，你也治不过来，算了吧。”然后张长林被抓捕并没有供出程勇，但是曹斌发现了程勇以前的笔录，于是找到程勇问话，程勇说开厂赚了不少钱，无需干着犯法的事情去做亏本生意。不过到了晚上，程勇就和黄毛偷偷开车去拉药，上完卫生间后发现有警察，吓得黄毛撒腿跑了，独自开车引起警察的注意，谁都没想到被侧面出来的大卡车迎面撞上，最终黄毛死了，程勇大发雷霆把曹斌按在墙上不断责问。
黄毛的意外死亡，曹斌决定退出该案的调查。另一头印度药厂正面临控诉，但厂长愿意继续提供药品给程勇。此外思慧联系了不少各省的病友，这样的亏本生意可要补贴几十万。程勇把儿子送出国读书后，准备破釜沉舟。这天晚上，程勇在送药的过程中被警察一举抓获。程勇也认识到了错误。因程勇走私盗版药的本质是想救人，并非盈利，法院只判了他五年。在路上很多白血病人纷纷自发一同目送。程勇一案受到了政府的高度重视，因其案件的特殊性，他获取减刑提前释放。在政府持续推动下医疗体制得到持续改革，正版药被囊入医保，不少的白血病人得到帮助。
《我不是药神》目前它是一个非常好的真是故事，它带有黑色幽默的色彩，也让人更加感同身受。没有人敢保证一辈子不生病不住院，近距离接触过“死亡”与“病患”的人，就能更深一点体会。电影带来不是感动，而是“压抑”，细想一下，现实也许更加残酷，更加让人无助。但在心如死灰中一定还有生活的希望。所以在囚车缓缓前行时，曾经救下过的人，发自内心的感激于程勇。他不是救世主，但他带来了“希望”。这才是我认为电影讲述的最珍贵的东西。
