御亲兵和镇台的设置，使得中央政府逐渐摆脱各强藩的节制，在废藩置县后，将全国的领地和兵权集中至中央政府。1872年11月，太政官颁布《征兵告谕》，否定了传统的身份等级差异，提出四民平等、全民皆兵：“士非从前之士，民非从前之民，均系皇国一般之民，报国之道亦应固无其别。”四民平等不仅是为了进一步去封建化，还为了更好的整顿军队。在此时的近卫兵（即御亲兵）和镇台中，绝大部分官兵都是旧藩士，封建等级和军队等级不相匹配，常常可见十四五石（俸禄）的下级武士统率二三百石的上级武士，还有士兵公然反抗其他藩出身的军官指挥，同时，随着去封建化的进展，士族们对明治政府的不满也影响着军队。在财政上，废藩置县后，明治政府担负起了士族官兵的俸禄，其支出高达财政收入的30%，对新生的明治政府是非常巨大的负担。和士族相比，征召平民进入军队，一方面由于平民习于服从，生性懦弱，易于管理，而且服役为国民之义务，政府只需发放少量的津贴，对财政是很大的帮助；同时，日本积极向西方学习，减少常备军的规模，取而代之的是大量短期服役的义务兵，退出现役役后即转入预备役，在战时便可动员相当数量的兵力。征兵制对日本建成现代国家的目标有很大的帮助，但是从中央到地方都有巨大的阻力。四民平等的征兵制，将从古至今由武士垄断的军职踩进了泥地里，陆军少将桐野利秋（萨摩出身）公开宣称：“把乡下佬集中起来，只能是制造人偶。究竟何益之有？”对于骄傲的武士们而言，战争是他们作为贵族的特权，平民即不能也不应该掺和进来。经济上，此时日本全国有四十余万名领取俸禄的士族，加上依靠俸禄过活的武士家人，总共超过两百万人，而废除藩兵后，由士族组成的近卫兵和镇台总计不过数万人，这意味着有大量的武士不得不另谋他业，对于武士的生计和荣誉而言是极大的打击。1876年，明治政府更是发行金禄公债代替传统俸禄，大大降低武士们的收入。在精神上，《征兵告谕》将武士称为“抗颜坐食”之徒，激怒了骄傲的武士们，1876年颁布的《废刀令》更是将武士魂踩在脚底，激起了大量的士族叛乱。
失去了军务和特权后的武士（乡士尤其）生活极其凄惨，还失去了佩刀的权利讽刺的是，得到了从军权利的平民们，也极力反对征兵制。其原因之一，竟是看不懂《征兵告谕》。《告谕》中有这么一段话：“凡天地之间，一事一物，无不有税，以充国用。然则，为人者，固应尽心尽力报国。西人称之为血税。以其生血报国之谓也。”对于知识水平低下的平民而言，《告谕》过于晦涩难懂，以至于民间充满了流言蜚语：有人将“西人”“血税”二词结合，得出“朝廷要把士兵的血卖给南蛮人”的结论；又有人认为是要用士兵的血酿葡萄酒；还有人认为是要用士兵的血去染军帽和军装……诸如此类，层出不穷，掌握了知识的士族反对派们自然不会放过这个机会，在1873年煽动北条县数万农民发起叛乱，反对征兵、学制（各地国民需义务自费建设小学）、剪发等革新政策，杀害了大量官吏和教师。6月中旬时，相邻的鸟取县有一农夫将陌生人误认为征兵官，导致了2.2万人参加的大暴动，暴动农民除反对征兵外，还要求废除小学，阳历等。6月下旬，名冬县也因类似原因造成了大暴动，被判万罪的人数高达.1.7万。这些平民是如此的愚昧，以至于明治政府不得不发布更加通俗易懂的《征兵通知》。除却愚昧的平民外，能够理解《告谕》内容的平民也同样不欢迎血税。在传统日本的认知中，无论是保家卫国还是征战四方，都是武士老爷的义务，和平民没有六文钱的关系，同时在农业占比极高的日本（中国同理），哪怕只是暂时失去壮劳力，对家庭经济状况的打击也非常沉重。陆军少将山田显义（长洲出身）提出，在实行征兵前应该完善国民义务教育，使国民理解服兵役对于国家的意义和重要性，同时在义务教育中加入军事训练，缩短服役期，减少家庭失去壮劳力的时间。然而，明治政府却急于替换近卫兵和镇台中的士族官兵，为了镇压正在/将来叛乱的士族和农民，不得不加快征兵的进程。
早期御亲兵军装，已经是南蛮人的形状了
山县有朋注意到征兵对于贫苦平民的负担，于是考虑从家境富裕的人当中优先征兵，但是1873年《征兵令》却规定可以通过缴纳270日圆替代金以免服兵役，以福知山藩为例，1887年时藩主共有金禄公债36578圆，年息2560圆，该藩一中级武士持有公债790圆，年息仅55圆，哪怕是后来的总理大臣伊藤博文，其月薪也不过800圆，而普通的农村雇工每日工钱仅15.5钱，月收入不过3.5圆。如此不平等，使得国民对征兵更加厌恶，社会上逃避兵役风气横行，更是有专门研究征兵漏洞的《征兵遁法》出版。《征兵令》规定，除缴纳替代金外，体格不良者、陆海军官校学生、官吏、制定学校学生及留学生、户主及继承人、父兄患病而必须支撑家庭者、兄弟正在服兵役者、罪犯等人也可免服兵役，于是人们充分利用了这些规定。例如有人将次子三子分家成为户主，还有人过继进入别家成为养嗣子，后者被称为“军队养子”“征兵养子”。此时的《征兵令》还不适用于北海道和冲绳，便有人将户籍迁往两地以逃避兵役。即没有能力分家，也没有亲戚收养，更没有能力移籍的人，还会选择善意犯罪，似乎认为蹲几天牢房好过蹲3年军营。由于兵员严重不足和财政问题，明治政府选择征召少量现役兵，长期服役（三年）培养精兵，以完成国防的需要。士气低下，训练短暂（相较于士族），征召兵在各地的平叛实战中远远不及士族兵活跃，似乎印证了桐叶少将的说法，使得人们开始怀疑征兵的作用和必要性，哪怕是镇台的指挥官，也对自己的手下缺乏信心，这样的状态直到西南战争，这些被迫扛起步枪的士兵才证明了自己的能力。
