督查组还发现，在农田水利设施建设各类项目资金落实的过程中，中央资金有效发挥了引导作用，但地方特别是市县的配套资金很多时候都未拨付到位，影响建设质量和后期管护。
督查组建议，通辽市全面组织排查整改，及时组织抢修维护，逐项销号，举一反三。理顺监管维护机制，压实有关主管部门和上级政府对农田水利设施的监督和管理责任，避免事权和支出责任完全下压到基层乡镇和村集体。统筹整合相关专项资金，重点保障存量农田水利项目的日常维护。
此外，要发挥村民监督作用，在农田水利设施规划设计、竣工验收、移交管护等各个环节邀请村民参与，使农田水利设施建设项目从“政府要建”变成“村民要建”“村民要管”。
针对督查组督查反馈的问题，通辽市组建专班进驻科左后旗，并且对全市高标准农田建设情况进行排查整改，明确8月31日前全面完成排查任务。截至8月25日，科左后旗已派出103组258名干部会同全旗19个苏木镇（场）党委、政府开展实地排查，已累计排查机电井1751眼，其中查出问题井401眼。
