从隋代开始，常州经济文化发展加快，在全国的重要位置凸显，成为江东望州。隋开皇九年(589年)，晋陵郡改称常州，治所移到常熟县，常州由此得名，后常熟县改属苏州，常州治所移到晋陵。当时常州下属晋陵、无锡、义兴、江阴四县，水世县并入溧阳县，与延陵同属蒋州(9年后溧阳县改名为溧水县)。隋帝大业三年(607年)，废常州置郡，又改称常州为毗陵郡。大业十三年，延陵县金山府乡人自立县，属金山县，属江都郡。唐武德元年(618年)，高祖李渊登帝位，恢复隋开皇旧制，下令改郡为州。武德二年，沈法兴以陵为都，自称梁王，年号延康。武德三年，李子通败沈法兴据陵，吴王杜威又平李子通，改毗陵郡为常州，并以故兰陵地置武进县，属常州。同年，划溧水县东部为溧阳县，属扬州。唐太宗贞观年(627年)，并武进县于晋陵县。武后垂拱二年(686年)，复析晋陵县西北36乡重置武进县。时常州下辖晋陵、武进、无锡、义兴、江阴五县。至武后垂拱四年，因东南郡已有金山县，县境内茅山华阳洞内传说有“金坛百丈”，金山县更名为金坛县，属润州。建中元年(780年)，浙江分东、西两道，常州属浙江西道。唐景福元年(892年)常州筑内子城，周围2里318步，高2丈1尺。五代十国时，中原战乱，常州先后属杨吴、南唐。吴容帝杨溥顺义三年一六年(923-926年)，武进原在常州西北万绥的故城治所因战后残破而迁治于常州城。筑外子城，城门有四:东迎春，西迎秋、南金斗、北极，门外有池，周围7里30步，高28尺，厚2丈，内外筑以砖石。吴天祚元年(936年)，筑罗城，周27里37步，高1丈，有八门:东通吴、次东怀德、南德安、次南广化、西朝京、北青山、次北和政、东北东。外有池，上有御敌楼。
宋开宝八年(975年)，常州归宋。常州下辖晋陵、武进、义兴、无锡四县。雍四年(987年)，常州属江南道。至道三年(997年)，全国分为15路，常州属两浙路。宋代，溧阳先后属江宁府、异州、建康府。北宋时，金坛先后属两浙路润州、镇江府，南宋时，属两浙西路镇江府。此后至清代，金坛均属镇江府。南宋末年，蒙元南征。宋德祐元年(1275年)，元将伯颜率元军进攻常州，常州(武进、晋陵县城)军民坚决抵抗，在常州知州姚率领下，通判陈、都统刘师勇、副都统王安节、武进知县包圭、节度判官胡应炎、偏将张超等两万义军抵抗20万元军围攻，坚守半年，被誉为“纸城铁人”，最后常州城陷，遭屠城。
元至元十三年(1276年)，常州属行中书省(治所临安)。翌年，常州升为路，属江浙路中书省。此后递属江行中书省，江浙等处行中书省。常州路下辖武进县、晋陵县、无锡州、宜兴州和一个录事司。元代，阳曾改为州、溧阳府、溧阳路、溧阳县，溧阳县属建康路、集庆路。元末，张士诚、朱元璋依托江南起义，反抗元朝统治。至正十五年(1355年)，朱元璋部将徐达攻占课阳。翌年，张诚攻占常州，将常州易名为毗陵郡。至正十八年(1358年)，张士诚败退，常州为朱元璋部所据。朱元璋将常州地区划出两浙，属南直隶，又改常州路为长春府，改武进为永定，晋陵为京临，不久并京临入永定。至正二十二年，仍改永定为武进，府辖武进、无锡、宜兴、江阴(靖江)四县。曾用，晋陵县为名1047年。从此，晋陵成为一个历史名称。
明清时期，常州发展成为全国经济文化重镇，至清代时已成为“八邑名都”。明洪武元年(1368年)，常州府属直隶中书省。明洪武三年，常州驻重兵，守御宫中山侯汤和收缩四面城墙，在罗城内改筑新城，罗城废，常州城周长从南唐的罗城27里37步缩小到新城的10里284步，高2丈5尺，筑以砖石，有七门:东南西北和次北名称仍旧，次东怀德改东箭，次南广化改石幢，门各有楼，外有瓮城，水关有四:正东东水关、正西西水关、东北北水关、西北小西水关。成化十八年(1482年)，又增高3尺，并将中箭，石幢2门名为怀德、广化。正德六年(1511年)，更茸新，扩建走马道，广丈余。嘉靖间又整修。万历三十年(1602年)，自通吴门延袤至北水关，筑重墙180余丈。清康熙九年(1670年)、二十年，雍正四年(1726年)，乾隆二十九年(1764年)均整修。至清末，城门有七:东门通吴、大南门德安、小南门广化、老西门朝京、新西门文在，大北门青山，小北门和政，又辟博爱门、西瀛门，关建东水关、西水关、水关。此后一直到民国，常州城都以新城为范围。洪武十年(1377年)，常州直隶京师。洪武十三年常州改为直于六部。水乐七年(1409年)长春府复改称常州府，府署置武进县城，沿用至清末，500年时间。水乐十八年常州属南直隶。明成化七年(1471年)，常州下武进、无锡、宜兴江阴、靖江五县。万历末年(1619年)，避光宗朱常洛讳，常州一度改为尝州府。明代，阳初为州，后为县，属应天府。清顺治二年(1645年)，清军占领常州城。清代沿明制，常州为府，领五县，隶属江南布政司。顺治十八年，常州又属右布政司。康熙六年(1667年)，常州府属江苏省。至雍正四年(1726年)，常州府辖武进、阳湖、无锡、金匮、宜兴、判溪、江阴、靖江八县，由此被誉为“八邑名都”。清代，深阳先后隶属江宁府、镇江府。丰年间(1851-1861)太平天国运动兴起，太平军曾攻占阳、武进阳湖(常州城为府、县同属治所)、金坛，统治其境四年。期间，太平天国在此建常州郡，属苏福省。清同治三年(1864年)，溧阳县城、金坛县城及常州三城相继被清军攻占，复归清朝统治。
