（震网病毒版本，它跨越两位总统任期，经过了七年的持续开发和改进）
2006年伊朗重启核计划时，形势正如伊朗所料，美国的选择并不多。美军已经占领了伊拉克，却迟迟找不到传说中的大规模杀伤性武器，布什总统在国内国际政治上都处于被动局面，没有足够的政治能量再次以消灭核武器之名发动一场伊朗战争。但如果不解决伊朗核问题，又无法对以色列交待，因为伊朗一旦拥有核武器，首当其冲的使用目标必定是以色列，以色列感受到极大的威胁。以色列一再表态，要像1981年空袭伊拉克核反应堆一样，也对纳坦兹核工厂来一场外科手术式的打击，将伊朗核计划消灭在萌芽状态。如果任由以色列空袭伊朗，这无疑又将搅乱中东局势，使地区纷争进一步升级，当地的反美情绪也会更加狂热化。因此，当时的美国夹在以色列和伊朗之间左右为难。
万般无奈之下，布什总统接受了中央情报局的一个建议，向纳坦兹核工厂传播一点病毒。其初始目的，不过是给伊朗人制造一点麻烦，迟滞其核武器的制造进程，争取多一点时间，等到形势变得有利时再着手解决伊朗核问题。
为了安抚以色列，中央情报局拉上以色列情报部门一块儿干，以期把他们的注意力从空袭转向病毒。没想到，以色列态度很积极，还通过自己的间谍组织献上一份厚礼：他们偷到了纳坦兹核工厂的图纸！美国人喜出望外，立即决定升级原计划，搞一场大的。
病毒的目标从搞点小破坏，升级为感染全部设备，控制整个工厂。为了确保计划万无一失，美国人还按照图纸，造了一座模拟的核工厂。美国和以色列招募了一批顶级的黑客和核工程专家，在这片模拟战场上对症下药，针对其薄弱环节设计病毒，并且在实际运行中反复测试，反复改进。
布什总统任期快要结束的时候，病毒武器开发完成，测试结果非常成功。美国政府和中央情报局的首脑一起开会，讨论将其部署到实战中去。那场会开得并不轻松，与会者明白，病毒攻击势在必行，但同时他们也明白，这即将开启一个网络战争的时代。从前的病毒，其破坏不过是窃取一点数据，或者让电脑死机，总之都是电脑中来，电脑中去，限制在互联网中。这个病毒将第一次闯出潘多拉魔盒，杀进我们的现实世界，控制和破坏传统的机器设备。
当时的中央情报局局长迈克尔·海登形容会议气氛说：“我们是在跨越卢比孔河。”
关于震网病毒是怎样传播进纳坦兹核工厂的，广为流传的一个说法是，美国情报部门调查了核工厂工程师的背景，发现其中一个工程师特别喜欢钓鱼。于是他们派出一个特工，伪装成钓鱼爱好者，跟那位工程师交上了朋友。两人熟悉以后，特工给工程师发送一份邮件，邮件的内容是一张被震网病毒感染的钓鱼图片，工程师一打开图片，他的私人电脑就被感染了，并且随后感染到他的U盘。后来的某一天，那个工程师在工厂内使用了一次被感染的U盘，病毒就此传进了核工厂内，一步步地感染到所有设备，并且控制了离心机的运行。
这种说法未经证实，其中有一些显然是附会上去的。例如钓鱼，其实“钓鱼”在信息安全界是一个专有名词，是指架设一个假的银行或社交媒体的网站，引诱用户输入其信用卡或个人账户的帐号和密码，从而窃取个人信息。在这个故事里，“钓鱼”从喻体转回本体，变成了一种真实的活动，显然是以讹传讹了。
但有一点是研究者所公认的：病毒必定是通过U盘传进工厂的。核工厂跟大部分工程设施一样，内部的控制网络跟外部互联网是完全隔离的，彻底断绝从互联网上发动的攻击。病毒根本无法从网络连接传进去，唯一可能的途径就是内部设备上的USB接口。这一结论，从震网病毒特意加强的USB传播能力也能得到证实。病毒开发者拥有一座模拟工厂，在实际测试中，他们必定也早已发现，USB口才是唯一的突破口。
至于具体的传播者，美国人自然不肯透露。但据研究者推测，不大可能是无意中掉入圈套的工程师，倒更有可能是被收买的内部人员。因为病毒版本更新比较频繁，而U盘的使用是偶尔的、不定期的，靠无意中的USB感染，不能保证新的病毒版本及时传入工厂。
病毒的频繁更新非常重要，它使得每隔一段时期，故障的发作形式就会变化。在美国的模拟工厂中，病毒开发者一直试验着各种破坏方式。相应地，在伊朗的真实工厂，离心机也不停变换着报废原因，时而是转子磨损，时而是压力阀损坏，繁复多变，不一而足。伊朗人只能看到故障频发，却因为故障类型变化无常，始终无法积累足够的经验，搞不清到底是出了什么毛病。核工厂频频停工检修，生产计划被彻底打乱了。
