上述指控，涉及三名公职人员。2021年11月29日，已退休一年的姚庆艳被查，陈武现任安徽省检察院党组书记、检察长，罗衡宁现任长沙市人大常委会副主任。相关证言显示，陈武和罗衡宁均表示自己没在上述相关案件中帮过忙。
在庭审时，肖卓对上述指控全部否认。肖卓与其律师均认为，从林旭钧、杨伟源处收到的钱，都是借款行为，用途在买房及家人投资入股等方面。肖卓称，他跟这三人的交往“都是正常的，是私人朋友间的经济往来，没有以权谋私、输送利益”。
但公诉人出示的林旭钧证言显示：“肖卓是秦光荣身边的人，当时已经在云南省政法委任职。我看好肖卓在政治上的发展，因为他的身份和背景，我想通过贿赂他支付房款等进一步拉近和他的关系，特别是今后有什么事情，可以找他帮帮忙。2001年左右，肖卓说他认识烟草系统的姚庆艳，我说看以后能不能在这方面可以有合作，肖卓答复我说，会把姚庆艳约出来给我认识，但是肖卓从没把姚庆艳约出来给我认识。”
肖卓表示，他跟姚庆艳只有一面之交。2001年，他跟姚打过电话约其吃饭，但姚没出来，也并没有涉及要对林旭钧介绍烟草香精香料生意的事项。2014年他介绍陈武给杨伟源认识，并没有检方指控的意图，“到今天为止，杨都没有告诉过我，他为弟弟的刑事案件找过陈武”。
杨伟源的证言称：2014年左右，他弟弟杨锡波被佛山市检察院起诉。通过肖卓帮忙，他找到了时任广东省检察院常务副检察长陈武，帮忙过问案件。
陈武的证言称：“2014年左右的一天，肖卓跟我说他有一个朋友叫杨伟源，是广东人，家里有很多亲人在广州做生意，想到广州拜访我，我说可以的。大概过了半个月，杨伟源到广州，我让他到我的办公室聊天，杨伟源在我的办公室中，说起他弟弟在老家有一些事情，好像是涉及刑事案件方面，想请我帮忙，找揭阳市相关领导解决一下。我跟他说潮汕地区不熟，没有办法帮他协调。”
公诉人认为：以上两个证据证实，2014年肖卓受杨伟源请托，介绍陈武给杨伟源认识，并且为杨伟源之弟杨锡波所涉刑事案件从宽处理提供帮助。
肖卓称，检方指控的他跟杨伟源之间265万所谓索要收受贿赂根本不存在。这些借款都是他跟杨伟源在私人朋友之间有具体事由的，有还款有借款的承诺约定的，有还款的事实。
但杨伟源证言称，肖卓从来没有归还过借款，向他借款时从来没有写过借条，也没有和约定还款期限和利息，“在我看来，肖卓内心其实根本不想还钱给我，于是以借款的名义在向我索要钱财，要知道当时肖卓已经是省检察院副检察长，和秦光荣关系不一般”。
肖卓称，雷武军的150万，是他小舅子周吉姬个人所借所用，他根本不知道。他跟雷武军没有一分钱的借贷，也不存在起诉书中提到的他意图在拍卖土地方面为雷武军提供帮助的事情，为雷武军在昆明的民商事案件纠纷提供帮助，这种事情更是与基本事实不符。
他称，“雷武军所谓的民商事纠纷一审败诉后，他把一个申诉材料发给我看，把一些情况讲给我听。我们作为检察机关的干部，我觉得这也是我的分内职责，他又是我朋友。我也没有干涉法院，只是把他的申诉材料转交给了时任昆明市法院院长訚柏，要他依法来审理。”
是否插手工程项目？
检方还指控肖卓犯有滥用职权罪。2009年，云南省检察院筹划建设新办公区及职工住宅小区项目，云南省城市建设投资集团有限公司（下称“云南城投”）为代建方。云南省检察院成立基建工作领导小组，肖卓担任副组长，负责基建工作领导小组日常工作及与云南城投集团等单位的协调工作。
检方指控：2011年，肖卓擅自决定并通知云南城投，由省检察院基建工作领导小组纪检监察与综合组副组长耿光瑞（另案处理）负责防水工程项目。耿光瑞向肖卓提议由耿光瑞的二哥耿前进、肖卓姐夫戴汉全承揽防水工程项目。
检方指控：肖卓在明知耿前进及戴汉全无防水施工专业资质、违规借用其他公司资质承揽工程的情况下，仍徇私情，擅自决定将防水工程交由耿前进承揽，并由戴汉全共同实施。后耿前进、戴汉全借用昆明太阳城防水材料工程有限公司资质，未经招投标程序，以先进场施工、后补签合同的方式，承揽实施了云南省检察院莲荷苑、平和花园、万和花园等办公项目及职工住宅项目的防水工程。耿前进对防水工程施工综合单价的报价明显高于市场价格，导致工程造价虚高，且平和花园、万和花园项目出现大量房屋漏水等防水质量问题。经鉴定，云南省检察院基建项目防水工程造价高于市场价人民币610.422752万元。
