锌对男性第二性征的发育和女性各阶段的生殖系统都有重要影响。如果锌缺乏或不足，男性和女性器官的发育会明显延迟，甚至发育不全。比如缺锌的人，乳房、阴毛、生殖器的发育都会有不同程度的缺陷。这种阻碍第二性征发育的主要原因是性激素的产生减少。例如，缺锌使睾丸中蛋白质的合成减少，睾丸和附睾萎缩，与睾丸有关的某些酶和激素的活性和分泌减少。
儿童期缺锌会导致发育迟缓、缺锌性侏儒症或类似症状。垂体分泌的促性腺激素是决定男女骨骼特征的主要激素。进入青春期后，人体各部位的肌肉发育、脂肪储存和分布，以及皮肤的粗糙、柔嫩、光泽，很大程度上都受到性激素的影响，最终影响身高、体型，甚至男性肩部宽度，女性三围（胸围、腰围、臀围）比例。锌是性激素的重要成分。其他人则认为，十一或十二岁的女孩通常比男孩高一个头。这是因为男孩体内的锌几乎完全供应了性器官发育的需要，并没有多余的锌来供应骨骼的生长。.一旦青春期结束，男孩会在短短几个月内突然长得比女孩高。男孩体内锌含量充足，长得更高，生理成熟更快。在埃及和伊朗，由于地球化学结构和饮食习惯，缺锌症状更为常见，因此青年男女第二性征的抑制也更为普遍。
锌对性器官的发育和性功能也很重要。缺锌者生殖器官发育不全，月经停止或无月经；缺锌还会减慢睾丸的发育，包括附睾和前列腺发育以及睾丸生精的减慢。原有上皮萎缩，从而影响性功能。对于正常健康人来说，前列腺、精液和精子细胞中的锌含量都比较高。正常人前列腺中的锌含量为859/万，射精的初、中、末部分分别为：2930/万、1480、910/万，精子本身含锌1990/万，而肝脏和肾脏中的锌含量仅为第一次射精中锌含量的1/2和1/7。锌不仅对于精子的产生是必需的，而且对于维持精液上皮的健康也是必需的。长期缺锌会使血浆中的睾酮显着降低，影响前列腺的结构和功能，引起相应的性功能下降，甚至不育。因此，国外有人称锌为“夫妻和睦的元素”。
研究及相关测试表明，血液中锌浓度低时，阴茎勃起、射精状态、性交次数均有明显改善，精力充沛。锌也是前列腺所必需的，前列腺是一种分泌控制射精的男性腺体，但并不是每个人都有功能正常的前列腺，几乎所有60岁以上的男性都有前列腺肥大的问题，医生称其为良性前列腺过多20-60岁的男性常患前列腺炎，前列腺肥大会导致性功能下降，甚至阳痿。据测定，这类疾病患者前列腺中的锌含量相当低，补锌后身体状况明显好转。锌还可以治疗前列腺肥大。每天给予150毫克锌，2个月后减至每天50-100毫克。大多数人的病情可以得到缓解。
