在乌干达的一项研究中，男性和女性都发现未受割礼的男性很难保持生殖器清洁，尽管未受割礼的男性和未受割礼的男性在卫生习惯上没有差异。需要进一步的研究来阐明生殖器卫生与HIV和其他生殖器感染之间的关系。
性传播疾病
包皮保存与除HIV以外的性传播疾病（STD）之间的关系很复杂，并且因STD而异。至少有11项研究有力地证明了溃疡性STD（尤其是软下疳和梅毒）与未进行包皮环切术之间的关联。两项研究报告了生殖器疱疹与未进行包皮环切术之间存在统计学上显着的关系，而四项研究报告没有相关性。五项研究报告了淋病与未进行包皮环切术之间的显着关系，两项研究报告没有相关性。两项研究报告了衣原体非淋球菌或其他类型的尿道炎与非包皮环切术之间存在显着关系，三项研究报告了包皮环切术的风险增加，三项研究报告没有关系。一项研究报告了尖锐湿疣与缺乏包皮环切术之间存在显着关联，一项研究报告了包皮环切术的风险增加，而另一项研究报告没有相关性。此外，一些研究报告说，未受割礼的包皮与厌氧菌以及革兰氏阴性杆菌、链球菌和支原体的存在有关。这些细菌可能会传染给女性，导致细菌性阴道综合症。尽管这些研究有些矛盾，但非包皮环切术与软下疳、生殖器疱疹和淋病之间的关联是完全一致的。只有非淋菌性尿道炎与尖锐湿疣和包皮环切术的关系尚未定论。
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