正中大字“西方极乐世界阿弥陀佛安养道场”。此活动虽空间宽敞,但光线昏暗,顶棚低矮。
三层“普明圆觉”称瑜伽层,供奉以大日如来佛为中心的瑜伽部佛像五尊,均着菩萨装,采取将右脚盘放于左腿上,左脚盘放于右腿上坐姿。佛龛汉文:“此层供奉瑜伽品佛,应念瑜伽品内金刚界毗卢佛、成就佛、最上功德佛、普慧毗卢佛、度生佛等经”。
顶层面阔、进深各1间,正面开4扇槅扇门,两侧为槅扇窗并环以琉璃挂檐板。
顶层称无上层,也是最为神秘的无上瑜伽部三位主尊佛所在,供奉密集金刚、大威德金刚、胜乐金刚各一尊,位置与底层坛城的主尊保持一致,拉萨上下密院主修的就是这三大金刚。
雨花阁严格按照藏密的事、行、瑜伽、无上瑜伽四部设计。密宗四层佛像合计26尊,每一尊神都有其确定位置,它们的排列组合与密宗仪轨紧密相关。
每年四月初八日,宫中派喇嘛5名在雨花阁无上层诵大布畏坛城经。二月及八月初八日,各派喇嘛10名在瑜珈层诵毗卢佛坛城经。三月及六月初八、九月及十二月十五日,各派喇嘛15名在智行层诵释伽佛坛城经。每月初六日,在德行层安放乌卜藏经。
雨花阁是目前我国现存最完整的藏密四部神殿,对于研究藏传佛教具有重要的意义。由于物件摆放密集且容易损坏,这里不具备开放条件。