万历年间，又有姓董的太监在山上建碧霞元君庙。如今，石景山上有两座碧霞元君庙，一座是正德年间钱宁所修，另一座是万历年间董姓太监所建。据清人笔记《戴斗夜谈》中说，石景山上的碧霞元君祠建成之后，“都人岁以元日往祀，至四月士女又群集”。
石景山上的古建筑，在日本侵华时期遭到严重毁坏。
登高观河 亦为治水
石景山西临永定河，遥望北京城，自古以来是寻秋揽胜的登高处，更是观察永定河的最佳地点。刘侗《帝京景物略》中说：“（石景）山最上，金阁寺。寺最宜远眺。望苍黄一道如带南缀者，浑河也。”
有文字记载最早登临石景山的，恐怕是三国时期的刘靖了。嘉平二年（250年）镇北将军刘靖在梁山（今石景山）上观察地形之后，命部下修了一道拦水堤坝（即戾陵堰），将河水导入水渠，再经高梁河东流，“灌田岁二千顷，凡所封地百余万亩”。这是北京地区史上最早的水利工程。其确切位置在哪看法不一，有说在石景山南，有说在石景山北。
明正德十二年（1517年）五月，“上微行至石径山”——武宗朱厚照穿着便服来到石景山，他是被钱宁带着来游玩的。
万历十五年（1587年）九月，二十四岁的神宗朱翊钧带着大臣们登上石景山，来视察永定河。此行《明史》上有记录：“上先登板桥，诸臣翼而趋”。万历问随行大臣：“（浑河）水从何来？”大臣申时行回答：“从大漠经居庸，下天津，则朝宗海矣。”申时行说的其实并不准确，恐怕他也不知道，只好信口一说。朱翊钧说：“今见（浑河）河流汹涌如此，知黄河经理倍难”。
康熙皇帝为治理永定河水患，多次来石景山一带巡查。康熙十七年（1678年）五月十六日、十七日，他在山上驻跸两天，写下了《驻跸石景山》《石景山东望》《察永定河》等诗篇，留下了“驻跸荒亭日欲斜”“峰崖高处有人家”，“地镇崚嶒标异秀，凤城遥在白云中”等诗句。
雍正七年（1729年），世宗胤禛拟在永定河上游建庙以供奉河神，命怡亲王来石景山择地，后在山南庞村之西，修建了一座惠济庙。因卢沟桥南康熙年间建有一座惠济庙，于是将这座称北惠济庙。如今雍正的御制碑尚存，正面是雍正皇帝撰写的碑文，碑阴刻的是乾隆皇帝的诗：《石景山初礼惠济庙》《礼北惠济庙》，人称“父子同碑”。由此可证，乾隆也不止一次来石景山。
今在碧霞元君殿南侧还能找到一块诗碑，上面刻着《登石景山》诗：“古寺荒凉雀可罗，漫游著屐上山阿。西来翠岫晴方好，南去浑河浊浪多。欲把新诗期惠远，惭无清供礼维摩。阑珊归思斜阳里，一路秋风集马驼。”此诗作于同治辛未（1871年），作者叫桂本成，是贵池人（今属安徽省池州市）。在诗人当时的视野里，石景山下聚集着许多骆驼。不用说，它们是由门头沟往城里驮煤的。
新修复的碧霞元君庙前的戏台。宗春启 摄
修缮一新的石景山，如今成为新首钢园内的一个景点。登临山顶，可远看首钢大桥和园博园的宝塔，天气晴朗时，向东可望长安街，以及更东边的国贸建筑群。
