第二种说法：元朝不止一座都城，除了位于燕山以南的都城——大都外，在燕山以北还有一座上都。
元上都遗址博物馆
元上都遗址位于今内蒙古锡林郭勒盟正蓝旗境内，处在北京正北略偏西一点的位置。若将北京中轴线向北延长270公里，则基本能与元上都连成一线（实际上仍有一定的误差，两者之间的距离相差了5公里多）。
中轴线为“两都连线”这种说法，也得到了许多人的支持，支持者认为这个误差，是因为当时测量方法的局限而产生的。
元上都遗址
第三种说法：元大都的中轴线本来就是指向正南正北的，但在实际施工时遇到了问题。
按照这种说法，元大都原本设计的中轴线，轴心为积水潭的最东端一点。在修建城墙的时候，东侧城墙位置上遇有低洼地带，必须向西收缩一点，这样中轴线也整体向西移了一段位置。
就这么稍微一移动，中轴线的中段部分竟然处在了积水潭的水面之上，水面又怎么能搭建起建筑来呢？于是施工者采取了让中轴线南段不变，北段西移的权宜之计，南北两段发生错位，这就造成了今天中轴线偏斜的现状。
按照这种说法，由于东城墙外的低洼地形，导致城墙向西缩进，进而导致城内出现了南北两段错位的中轴
对称的秩序与艺术
元朝统治结束后，北京这座连通中原、东北与蒙古高原，又有燕山之险的古都，仍然是明清两朝建都的首要选择。
明代在元大都的基础之上营建了新的京城，清代京师则基本保留了明代都城原貌，并进行了扩建。经过历代发展，逐渐形成了今天北京中轴线上，由43座古建筑组成的宏伟的大建筑群。
明清北京城的内城和外城
秩序与规则，既是北京的设计特点，也是建城思路。而中轴线，就是这种特点和思路的集中体现，北京城的宫殿、庙宇和城墙，都均匀排布、分布于中轴线的两边。
北京轮廓清晰可见
梁思成对于北京中轴线的定义是：中国古代大建筑群平面中统率全局的轴线。
