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专访陈佳教授:用新型变形式碱基编辑,解决临床应用关键障碍

常驻编辑 健康常识 2022-12-09 碱基   脱氨酶   胞嘧啶   编辑   基因治疗   编辑器   载体   基因   专访   障碍   百科   教授   形式   关键   结构
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我们做了一些实验,发现并不是缺一不可,反而是缺一更可了,还发现,这两个结构域去掉其中一个之后,另一个具有脱氨活性的结构域的碱基转化率反而更高了,我们就把它定义为胞嘧啶脱氨酶抑制(dCDI)结构域,后续我们也筛选了不同物种双结构域的胞嘧啶脱氨酶,发现来源于小鼠的APOBEC3,其第二个结构域的抑制脱氨活性是最强的,我们把它定义为最终tBE当中使用的胞嘧啶脱氨酶抑制结构域。让它变成一个锁,牵制住碱基编辑器在脱靶位点的突变作用。V52拜客生活常识网


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难点在于如何保证系统当中的钥匙,就是TEV酶只会在靶向位点进行解锁,而不会在脱靶位点解锁,我们尝试了很多种方法,发现只有当TEV酶被拆开,其中一个半端被招募,而另外一个半端处于完全游离的状态,这种情况下才有更高的特异性。V52拜客生活常识网


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未来百科:你们这项最新研究使用了双载体腺相关病毒,这么做的原因和难点是什么呢?

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王丽洁:AAV病毒现在已经被广泛用作基因治疗递送载体了,但是它有一个特点,就是单个AAV载体都有一个4.7kbp的基因包装上限,也就是需要递送的基因长度超过4.7kbp,AAV载体就装载不了了。但大部分传统的碱基编辑器,采用的是APOBEC与nCas9融合蛋白,它远远超过了单个AAV载体的装载上限,这就需要将碱基编辑器拆分成两个部分来分别放到两个AAV载体上。V52拜客生活常识网


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tBE是由天然的两个载体构成,就是说APOBEC和nCas9天然就是分开的,它打破了传统的构型,并且每个结构都没有超过单个AAV载体的装载上限,那么它就可以被非常便利地装载进双AAV系统当中进行体内的递送,当然这不是说我们一开始就是这么设计的,而是我们在后期鉴定tBE系统能否进行体内(in vivo)碱基编辑时惊喜地发现它刚好可以这样通过双AAV载体递送。V52拜客生活常识网


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未来百科:在科研的过程中,可能每天都会经历从boring到失望再到惊喜的过程,如何调整自己的心态?

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王丽洁:实验失败其实是一件非常常见的事情,我的建议是用平常心去做每一个实验,这样最后的收获就会比一开始预想的要多一些。实验结果与预期不符其实也并不是一件很糟糕的事情,有的时候可能还会带来一些新的思路和方向。

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未来百科:正序生物其他专利的碱基编辑器、技术原理,还有各自的优劣势有哪些呢。

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