清朝入关后，明朝的皇统清朝是接受的。即便是崇祯帝也不例外，但对于被嘉靖帝拖入太庙的这位兴献皇帝，清朝却不予承认。
当然追尊先祖也不是不可以，一般来有几种情况，一种是开国之君或创业之主，一般都会追尊自己的父祖。二是太子在任上薨逝，继任者承认太子的身份，一般也予以追尊，如朱元璋的太子朱标死后，皇太孙朱允炆继位，追尊朱标为明兴宗。
但朱厚熜由小宗入大宗，他自己既不是开国之君和创业之主，他父亲也没有做过一天太子，更没有做过一天皇帝，而将其予以追尊并最终将其供入太庙，这确实不地道。
说了这么多，嘉靖帝与朝臣之间关于生父与生母的身份，祭祀礼仪问题的争论，与朱棣又有什么关系呢？关系大着呢。
朱厚熜由藩王升任皇帝，朱棣从侄子朱允炆手中抢得帝位，两者都是小宗入大宗，只不过前者是和平手段，后者是武力手段。
朱厚熜将朱棣的庙号由“明太宗”改为“明成祖”，在朱厚熜看来，都是小宗入大宗，人家都称祖了，我抬个父亲入太庙又有什么关系呢？
朱棣由明太宗变成了明成祖，是他的孙子的孙子的孙子嘉靖皇帝干的，嘉靖皇帝干这事儿其实不地道，又实在没有办法，这其中牵扯到一个历史上著名的政治事件——大礼仪事件。
在嘉靖皇帝以前，朱棣的庙号一直都是明太宗，这符合中国自古以来的礼制，比如朱棣庙号为太宗，谥号为体天弘道高明广运圣武神功纯仁至孝文皇帝，简称文皇帝。
朱棣的庙号怎么从太宗变为成祖的呢？“祖”按照礼制，只能是开国之君的庙号才对，明朝唯一享有“祖”为庙号的是明太祖朱元璋。
朱棣的庙号被更改，这要从他死后100年后的嘉靖皇帝登基说起。嘉靖朱厚熜这个皇帝其实是捡来的，他的堂兄明武宗朱厚照一生贪玩，啥都玩了，就是没有留下子嗣，他年纪轻轻双腿一蹬，死了。朱厚照死了没关系，白布一盖，送入皇陵就行了，关键是皇帝谁来干？
当朝首辅杨廷和与太后商议，选来选去就选了朱厚照的堂弟朱厚熜来继承皇位。
17岁的朱厚熜进京继承了皇位，别看这小伙儿岁数不大，智商却超群，从进京的第一天开始，就与满朝文武斗上了，连三朝元老，内阁首辅杨廷和都不是他的对手。
杨廷和被嘉靖皇帝赶回老家（成都新都区）的起因是少年天子嘉靖皇帝要给自己死去的爹上皇帝谥号，并且要将他的牌位放进太庙里去。
这就过分了，本来这皇帝与朱厚熜这一支没有半毛钱关系，那是属于大宗朱厚照一支的，只是朱厚照死了无后，朝廷和皇室宗亲决定让朱厚熜来继承朱厚照的父亲朱佑樘的香火。简单地说，伯伯朱佑樘儿子死绝了，由朱厚熜来延续他的香火，他的爹不再是兴献王朱祐杬，而是朱佑樘。
先当儿子，再继承皇位，这是礼数。
17岁的嘉靖皇帝不这么想，老子光明正大的继承皇位，不是谁的继子，更不是来给谁延续香火的，我是我爹兴献王朱祐杬的儿子。
既然我当了皇帝，总不能委屈我爹朱祐杬，让他还只是个藩王，人虽然死了，但是尊位还是要有的。嘉靖皇帝朱厚熜决定要给爹一个身份，一个皇帝身份。
就因为这事儿，嘉靖朝闹腾了足足十年。
这不是一个简单的名分问题，这是整个明朝时期，文官集团和皇权第一次正面的冲突，更是一次旷日持久的政治斗争，谁赢谁就能占据主动权，哪一方赢，哪一方就能完全把控朝政。
明朝第一权谋家嘉靖皇帝赢得了最终的胜利，他都垮了几任内阁首辅，终于获得了可以给自己的爹一个皇帝尊号，把牌位放入太庙的机会。
可是这一切都搞定的时候，嘉靖皇帝突然发现一个问题：太庙没有位置了！
根据太庙规制，太庙里只能存放9任皇帝的牌位，九五之尊，九九之数。嘉靖皇帝是明朝第11任皇帝，以前的10个皇帝牌位正好有9个摆放在太庙里，唯一一个被丢出太庙的皇帝牌位是景泰帝朱祁钰的。
