人类产生于自然，人身体上的五脏六腑和组织结构本质上就是自然界能量运动的物质显化。中医定义的人体的脏腑结构以及经络气血名称完全来源于自然界。
心脏系统如同自然规律的绝对主导，负责按照自然规律向人体的各个器官发出命令。如果心出现问题，则经常会违背自然规律发出错误的命令来。肺如同主管自然界气候变化的“长官”，通过深长的呼吸将自然界的新鲜空气向人体各个组织进行分配，负责将清气上升，浊气下降，管理人体内的“气候环境”。肾是人体的水源供应系统，与其他系统协同将人体内的“水资源”向其他部位进行分配。如果肾系统出现问题，很容易导致身体缺水或者过量的蓄水。肝如同自然界的森林和植被系统，负责维护和保持身体的水土和新陈代谢，类比于森林湖泊，相当于身体的水土维护、水净化系统和身体的冷热调节系统（身体的冷热平衡因为良好的“水土”资源从而得以维持）。脾如同自然界的土壤系统，负责太阳能量的吸收、贮备和转化，同时也支持肝系统进行人体的“水土保持”功能。三焦是中医特有的概念，位于人体皮下的网络组织（胸膜、腹膜），如同自然界中地表或地下相互连接的水道网络，根据自然规律和人体的需求进行区域间的水资源调配。
《素问·五藏别论》说：“胃者，水谷之海，六府之大源也。五味入口，藏于胃，以养五藏气；气口亦太阴也，是以五脏六腑之气味，皆出于胃，变见于气口。”人饮用水和食物都会从口通过食道进入到胃，通过胃的消化将营养物质向下传入小肠，将糟粕物质再向下传递到大肠。在胃和小肠的消化吸收过程中将营养物质和水分通过胃和小肠周边的毛细血管进入到血液循环之中，再通过血液循环将营养物质带入到五脏中转化为精、血、气、神进行贮存和生理代谢。
岐伯说：“脑、髓、骨、脉、胆、女子胞，此六者，地气之所生也，皆藏于阴而象于地，故藏而不泻，名曰奇恒之府。夫胃、大肠、小肠、三焦、膀胱，此五者，天气之所生也，其气象天，故泻而不藏，此受五藏浊气，名曰传化之腑。此不能久留，输泻者也。魄门亦为五藏使，水谷不得久藏。所谓五脏者，藏精气而不泻也，故满而不能实。六府者，传化物而不藏，故实而不能满也。所以然者，水谷入口，则胃实而肠虚；食下，则肠实而胃虚，故曰实而不满，满而不实也。”
人体的
