自然界的能量变化都会在物质层面显化出来。人类是自然的产物，自然的力量作用在人体上，也会在人体的物质层面“显化”出来与之相应的脏腑或者组织。《金匮真言论》中说：“夫言人之阴阳，则外为阳，内为阴；言人身之阴阳，则背为阳，腹为阴；言人身之藏腑中阴阳，则藏者为阴，腑者为阳，肝、心、脾、肺、肾五藏皆为阴，胆、胃、大肠、小肠、膀胱、三焦六腑皆为阳。所以欲知阴中之阴、阳中之阳者何也？为冬病在阴，夏病在阳，春病在阴，秋病在阳，皆视其所在，为施针石也。”
简单来说，自然界气候不断阴阳变化在人体上对应形成阴阳不同属性的组织。从人体的构造来看，人体的背部温度通常比腹部温度要高。生活经历告诉我们，人体的腹部比背部更脆弱，腹部通常也比背部更怕冷，背部见到阳光的概率显然大于腹部。因此，人体的背部为阳，腹部为阴。从阴阳的角度来区分脏腑，人体的胆、胃、大肠、小肠、膀胱、三焦六腑都是“空心”的，主要是通过运动来代谢人体的水分和食物，所以属阳。肝、心、脾、肺、肾则是相对“实心”的，是相对“安静”的，用来贮存人体的精、血、气、神，所以属阴。
疾病的发生与季节气候的变化密切相关。春天人体的阳气正在从体内向体外生发扩散，阳气还不是很强大，人体体表气血的防御能力还不强，外邪入侵很容易“突破”人体防线造成五脏受邪，因此容易得“阴”病。夏天人体气血旺盛蓬勃于体表，外邪不太容易入侵到身体内，所以易患“阳”病。秋天人体的阳气也相对旺盛，正从体表向体内内收，所以邪气也不容易入“里”而生“阳”病。冬天人体气血内收到体内，外邪侵犯人体很容易导致“阴”病。所以中国的民间谚语常说“春捂秋冻”，就是指的春天要注意保暖扶助阳气的生发，而秋天适当的冻一冻可帮助阳气的收藏。
如果按照阴阳的观点，对人体部位进行进一步细分，则可分为“故背为阳，阳中之阳，心也；背为阳，阳中之阴，肺也；腹为阴，阴中之阴，肾也；腹为阴，阴中之阳，肝也；腹为阴，阴中之至阴，脾也。此皆阴阳表里、内外、雌雄相输应也，故以应天之阴阳也。”
人体的五脏六腑产生于自然的运动以及阴阳的变化
