自然界的五行变化在本质上是阴阳的变化。从本质上来看，五行是阴阳变化过程中更细分的变化，五行的变化使得阴阳的变化变得柔和并循序渐进。否则，阴阳的剧烈变化会导致气候剧烈变化，生命无法正常存在。春天阳气的生发用“木”的符号来代替，在这个符号的背后，隐藏的着生发、绿色、肝胆、眼睛、酸的味道等一系列的生命元素，其他的四行原理以此类推。掌握了这个自然规律，在治疗人体的疾病上思路就会简单容易起来。
就像任何事物都有两面一样，阴阳也是一个事物的两面。从阴阳的特点来区分，运动的、辛散的都属阳，内收的、沉重的都属阴。例如调节肝胆的药物，闻到像桂枝这些辛散芳香的药都是属阳的，而闻不出气味的药物的特点则是内收属阴的，如芍药。只有通过品尝才知道其味道是酸的。所以桂枝汤中桂枝和芍药的组合其实就是一对阴阳的组合，只有阴阳的组合才能持续实现事物的圆满和和谐，确保其实现应该有的功能。所以在治疗肝阳不足的时候，就通常以辛甘发散的药为君药，以酸苦收敛的药作为辅助药物。而在治疗肝血亏空、肝气亢奋时则通常以酸甘的药为主药，少量的辛散的药为辅助用药。仲景用药时通常是以阴阳组合为特点，不会单纯用阳药，或者单纯用阴药，只是根据病情有偏向而已。“阳中有阴、阴中有阳”的用药组合体现出“生命在运动中得以生存”，而运动的特点就是阴阳的持续不断变化。
所以说：“故善为脉者，谨察五藏六府，一逆一从，阴阳、表里、雌雄之纪，藏之心意，合心于精。非其人勿教，非其真勿授，是谓得道。”
与木类似，其他火、土、金、水的用药原理以此类推。
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